• पशु आनुवंशिक संपदा लक्षण वर्णन के लिए सर्वेक्षण पद्धति- नस्ल प्रलेखन के लिए इस्तेमाल किया जाता है ।
• पशु आनुवंशिक संपदा संरक्षण मॉडल -राज्य कृषि विश्वविद्यालयों, राज्यों के पशु पालन विभागों और विकास एजेंसीज द्वारा प्रयोग किया गया ।
• पशु आनुवंशिक संपदा पर डिजीटल डेटाबेस – निर्णय समर्थन में व्यापक रूप से इस्तेमाल किया जाता है।
• भेड़ में प्रजनन शक्ति जीन की जाँच- बहु-प्रजनक पशुओ की पहचान के लिए व्यापक रूप से इस्तेमाल किया जाता है।
• पशुधन प्रजातियों के मानक कार्योटाइप्स – प्रजनक बैलों में आनुवंशिक विकारों का पता लगाने के लिए गुणःसूत्रीय असामान्यताओं को नैदानिक उपकरण के रूप में इस्तेमाल किया जाता है।
• आण्विक विविधता विश्लेषण एक प्रजाति की विभिन्न नस्लों के बीच आनुवंशिक संबंधो की स्थापना के लिए मानकीकृत प्रोटोकॉल विकसित किया गया है।
• माइक्रोसेटेलाइट जीनोटाइपिंग पर आधारित नस्ल असाइनमेंट-व्यक्तिक से नस्ल /आबादी में निर्धारण।
• एकल सार्वभौमिक द्वैध पीसीआर द्वारा 6 गोवंश प्रजातियों में नव एकल सार्वभौमिक लिंग निर्धारण पद्धति।
• पितृत्व सत्यापन किट: गायें , भैंस, बकरी और ऊंट के लिए विकसित जबकि एक किट सब जुगाली करनेवाला पशुधन प्रजातियों-गायें , भैंस, बकरी, भेड़, याक और मिथुन में पितृत्व और संबंधित मुद्दों को हल कर सकती हैं ।
• भैंस और देशी पशुओं में दुग्ध श्रावण संबंधी जीव विज्ञान के आणविक पहलुओं का अध्ययन करने के लिए गैर इनवेसिव उपकरण।
• गाय और भैंस के दूध से थन उपकला कोशिकाओं (MECS) का विभेदन ।
• गाय और भैंस के मांस और दूध का पीसीआर आधारित विभेदन ।
• नव SNPs के पीसीआर RFLP और टेट्रा- एआरएसएस पीसीआर आधारित जीनोटाइपिंग से भैंस और बकरियों में एसोसिएशन के अध्ययन के लिए TLRs और अन्य कार्यात्मक जीन की पहचान ।

अधिकांश स्वदेशी नस्लों के विभिन्न प्रजातियों का प्ररूपी और आनुवंशिक रूप से लक्षण निर्धारण किया गया है।. नस्लों के लक्षण निर्धारण और दस्तावेजीकरण की वर्तमान स्थिति नीचे दी गई है:

विकास, उत्पादन, प्रतिरक्षा प्रतिक्रिया के लिए कैंडिडेट जीन लक्षण वर्णन और न्यूक्लियोटाइड स्तर पर ऊष्मा विनियमन बहुरूपताओं का पता चला। अलग जीन loci पर अलग-अलग फार्म प्रजातियों में SNPs की संख्या की पहचान की गई है।

गाय: म्योस्टेटिन , ऑस्टिओपॉन्टिन ,ग्रोथ हार्मोन रीलीसिंग हार्मोन रिसेप्टर, इंटरलुकिंस , विकास कारकों जैसे इंसुलिन, बुत्य्रोफिलिन1, 3, बीटा लैक्टोग्लॉब्युलिन, प्रोलैक्टिन, पिट्यूटरी-स्पेसिफिक ट्रांसक्रिप्शन कारक 1, कापा -कैसिइन, बीटा-कैसिइन, अल्फा एस 1 कैसिइन, अल्फा S2 के कैसिइन, गोजातीय वृद्धि हार्मोन, अल्फा लैटल्बुमिन , मोनोसीट केमोटेक्टिक प्रोटीन,इन्दुसिबल नाइट्रिक ऑक्साइड सिन्थेज़ जीन, गर्मी आघात प्रोटीन 70, पिट्यूटरी प्रतिलेखन कारक 1, diacylgylcerolacetyl ट्रांस्फ़्रेज़, टोल की तरह रिसेप्टर्स (1-10), गर्मी आघात प्रोटीन जीन 70.2, ग्लूकोज ट्रांसपोर्टर जीन आदि|

भैंस: म्योस्टेटिन , ऑस्टिओपॉन्टिन ,ग्रोथ हार्मोन रीलीसिंग हार्मोन रिसेप्टर, लेप्टिन, ABCG2, दूध कज़िन्स , लैक्टोग्लॉब्युलिन, इंटरलुकिंस, थन व्युत्पन्न विकास अवरोध करनेवाला, बीटा लैक्टोग्लॉब्युलिन, गर्मी आघात प्रोटीन 70, ठ्यरोग्लोब्युलिन , जैसे इंसुलिन वृद्धि कारक -1, calpastatin, गर्मी आघात प्रोटीन 70, पेप्टीडोग्लायकन मान्यता प्रोटीन,हप्टोग्लोबिन , फैटी एसिड सिन्थेज़, Calpain, calpastatin, लैक्टोफेरिन, टोल की तरह रिसेप्टर्स 1-10 जीन, लेप्टिन, स्तननिोकलकिन , मंजूरी की तरह रिसेप्टर्स 1 & 2, एटीपी बाध्यकारी कैसेट उपपरिवार जी सदस्य 2, CXC आकृति रिसेप्टर 2, प्रमुख उतक अनुरूपता जटिल डीक्यू एवं डॉ, का शमन tumorigenicity प्रोटीन 7, पेंटराक्सिन 3, सीरम एमीलोयड A1, S100 है कैल्शियम बाध्यकारी प्रोटीन ए 8, ट्यूमर नेक्रोसिस कारक अल्फा, diacylglycerolacetyl ट्रांस्फ़्रेज़ आदि|

भेड़: बरूला, वृद्धि हार्मोन, मध्यवर्ती टाइप -1 फिलामेंट ऊन केरातिन, बी 2 सी उच्च ऊन सल्फर प्रोटीन, ovine सिस्टीन और हिस्टडीन उच्च प्रोटीन, हड्डी मोरफोजेनेटिक प्रोटीन 15 बीटा लैक्टोग्लॉब्युलिन, विकास डि एफएफ erentiation कारक 8, Calpain, β3 एड्रीनर्जिक रिसेप्टर, वृद्धि हार्मोन रिसेप्टर, titin, calpastatin, फैटी एसिड बाध्यकारी प्रोटीन 3, प्रोलैक्टिन रिसेप्टर, diacylglycerol acyltransferase 1 आदि|

बकरी: लेप्टिन,कापा -कैसिइन, बीटा लैक्टोग्लॉब्युलिन, calpastatin, हड्डी मोरफोजेनेटिक प्रोटीन रिसेप्टर आईबी, हड्डी morphogenetic प्रोटीन 4, विकास विभेदक कारक 9, inhibin βB जीन, जी प्रोटीन युग्मित रिसेप्टर, kisspeptin, टोल लाइक रिसेप्टर – TLR2, TLR4, TLR5, TLR7 और TLR8, टोल लाइक रिसेप्ट, Calpain 1, aralkylamine एन acetyltransferase, पेप्टीडोग्लायकन मान्यता प्रोटीन 1, फैटी एसिड सिन्थेज़, एसिटाइल-कोए कार्बोज़ाइलेस अल्फा, SREBP दरार सक्रिय प्रोटीन, peroxisome proliferator सक्रिय रिसेप्टर गामा, ऑक्सीकरण एलडीएल रिसेप्टर, प्रोलैक्टिन, संकेत transducers और की activators ट्रांसक्रिप्शन, diacylglycerolacetyl ट्रांस्फ़्रेज़ आदि|

याक और मिथुन: अल्फा कैसिइन, acytl सह-ए और लिपोप्रोटीन लाइपेस, thyroglobulin, MHC वर्ग द्वितीय डीक्यू और डीआर जीन, टीएनएफ-अल्फा, haptoglobin आदि|

• एक संदर्भ के रूप में पशु जीनोम (Btau 4.0 संयोजन ) का उपयोग से भैंस मसौदा जीनोम संयोजन का निर्माण । असेंबली 17-19X की गहराई पढ़ा है। बफेलो असेंबली कैटल असेंबली Btau 4.0 की तुलना में ~ 91% -95% कवरेज का प्रतिनिधित्व करता है।
• दुग्ध काल के दौरान भैंस थन ग्रंथि की ट्रांस्क्रिप्टोम सिग्नेचर की स्थापना , पेचीदगी और बछिया के शारीरिक चरणों और स्टेज स्पेसिफिक जीन और पथ की पहचान ।
• साहीवाल गायों के दूध का ट्रांस्क्रिप्टोम वर्णन ।
• उच्च और निम्न पोषण व्यवस्थाओं के तहत FecB वाहक और गैर-वाहक भेड़ के साथ ही FecB वाहक भेड़ में उत्पादकता संबंधित जीन और fफोलिक्यूलोजेनेसिस का ट्रांस्क्रिप्शनल वर्णन।
• भैंस और बकरी में चयनित जीन का ऊतक वितरण वर्णन।
• भैंस थन ग्रन्थि से ईएसटी लाइब्रेरीज – 1200 से अधिक सीक्वेंस उत्पादन ।
• अलग -अलग उतक से RNA Seq आधारित सेक्वेन्सेस – (20 लाख से अधिक ); ड्रोमेदारिान ऊंट -5. 8 लाख, बक्ट्रियन ऊंट -3. 6 लाख ,भैंस -6 . 0 लाख , बकरी -4 . 6 लाख
• QTLs- भैंस विकास से संबंधित, दूध रचना और आठ विभिन्न गुणसूत्रों पर दूध उपज QTLs पहचान
• भैंस के 12 नस्लों से लगभग 8.5 लाख SNPs उत्पन्न किये ।

Ex-situ संरक्षण

• क्रायो संरक्षित वीर्य की कुल 1,28,074 डोज़ जो महत्वपूर्ण और लुप्तप्राय सात प्रजातियों ( गायें , भैंस , बकरी, भेड़, ऊंट, घोड़े और याक) का प्रतिनिधित्व रखती है, को राष्ट्रीय जीन बैंक में बनाए रखा जा रहा है ।
• पशु जीनोमिक संसाधन बैंक की स्थापना की है जो की विभिन्न पशुधन प्रजातियों की लगभग 80% भारतीय नस्लों के डीएनए के नमूने का संग्रह है ।

In-situ संरक्षण

• किसानों / प्रजनक नस्ल धारको को नस्ल से संबंधित प्रजनन क्षेत्र में तकनीकी जानकारी और प्रोत्साहन प्रदान करके संरक्षण का इन-सीटू मॉडल विकसित किया गया है और नेटवर्क प्रोजेक्ट के तहत राज्य कृषि और पशु चिकित्सा परियोजना विश्वविद्यालयों / राज्य पशुपालन विभागों / भारतीय कृषि अनुसंधान परिषद के संस्थानों और गैर सरकारी संगठनों के माध्यम से अपनाया गया है
• इन-सीटू संरक्षण परियोजना के तहत, हरियाणा, गुजरात, राजस्थान और उत्तर में स्थित गौशालाओं को रिकॉर्डिंग के लिए प्रोटोटाइप को बनाए रखने,बढ़ाने और स्वदेशी पशु नस्लों के संरक्षण हेतु उचित वकालत के लिए जांच की गई ।गौशालाओं में एक खुले नाभिक ढंग से शुद्ध नस्ल गायों से सांडो का उत्पादन करने के लिए एक नया मॉडल 10p विकसित किया गया ।