वर्ष 1926 के आरम्भ में कृषि पर रॉयल आयोग ने सिफारिश की कि भारत में पशुधन उत्पादन में योजनाबद्ध और व्यवस्थित अनुसंधान प्रयासों की आवश्यकता है । आयोग ने स्थिति का गंभीर विश्लेषण किया और पशु आनुवंशिकी और प्रजनन पर संस्थान स्थापना की जरूरत पर बल दिया । इसका आरम्भ 1940 में हुआ । जब आनुवंशिक अनुसंधान इकाई इंपीरियल पशु चिकित्सा अनुसंधान संस्थान, इज्जतनगर में स्थापित हुई ।

वर्ष 1984 में आईसीएआर-राष्ट्रीय पशु आनुवंशिक संसाधन ब्यूरो / आईसीएआर-राष्ट्रीय पशु आनुवंशिकी संस्थान की स्थापना देश में पिछले कुछ वर्षों में अग्रणी आनुवंशिकी विज्ञान द्वारा किए गए निरंतर प्रयासों का परिणाम था ।

आईसीएआर-राष्ट्रीय पशु आनुवंशिक संसाधन ब्यूरो / आईसीएआर-राष्ट्रीय पशु आनुवंशिकी संस्थान की स्थापना हेतु अनुमोदन चतुर्थ पंचवर्षीय योजना के दौरान किया गया था । इस संबंध में पांचवी और छठी पंचवर्षीय योजना में प्रभावी अनुवर्ती कदम लिए गए । अंत में, 21 सितंबर 1984 को राष्ट्रीय डेयरी अनुसंधान संस्थान (दक्षिणी क्षेत्रीय स्टेशन), बंगलौर, परिसर में ब्यूरों को स्थापित किया गया तथा 19 जुलाई 1985 को करनाल राष्ट्रीय डेयरी अनुसंधान संस्थान करनाल परिसर में अस्थायी रूप से स्थानांतरित किया गया ।